Эндоскопиялық емшаралардан кейін пациенттер тамағы жырылған сияқты сезімде болады. Бұл эндоскоптың жоғары өңеш сфинктері, ауыз жұтқыншағы арқылы өткендіктен, адам қақалып, тамақтың сілемейлі қабаты кішкене зақымданады.

    Кейде эндоскопты психологиялық тұрғыда енгізу қиын болады: адамда тұншығып кететіндей үрейлі қорқыныш пайда болады. Мұндай қорқыныштың негізі жоқ: құрылғы өңешке визуалды бақылаумен енгізіледі және тыныс алу жолдары толығымен бос қалады.

   Пациенттерді жиі мазалайтын тағы бір сұрақ – инфекция ықтималдығы.

   Жоғарыда аталған тәуекелдер Ұлттық ауруханасының эндоскопия бөлімшесінде болмайды.